L’origine de la CC2R remonte au 11 décembre 1991, date de création du District « Les Deux Rives ». A cette époque, seules les communes de Laveyron, Ponsas, Saint-Vallier et Sarras sont partie prenantes dans le projet.
Ces communes se sont d’abord rassemblées autour d’un nombre restreint de compétences : la gestion de terrains d’accueil pour les entreprises, la coordination de la gestion des SDIS, une réflexion sur l’habitat, un accompagnement de la vie associative. Ces communes seront rejointes au mois de décembre 1992, par Arras sur Rhône et Saint-Barthélemy de Vals. Il faudra attendre l’année 1996 pour que les contours du District englobent la commune d’Ozon, et le début de l’année 2002 pour qu’à son tour, la commune d’Eclassan rejoigne Les Deux Rives.
Entre temps, le 23 décembre 1999, le District s’était transformé en Communauté de communes « Les Deux Rives », et avait élargi ses domaines de compétence.